PNA 设计
PNA 设计注意事项：
1. 从理论上讲，PNA 可以从两个方向和目的片段形成杂交体，但实际上，最常见的是反向结合 (anti-parallel orientation)。
2. 通常 PNA-DNA 双链比相应的 DNA-DNA 双链的 Tm 值高。大概每个单体 Tm 值可提高 1℃。
3. 由于 PNA 与对应的 DNA 序列具有高亲和力，因此 PNA 不需要太长，一般 12-21 个碱基就可以。
4. 强烈建议防止自身互补 (Self-complementarity) 的发生。在序列设计上，避免反向重复 (inverserepeats)，发夹结构 (hairpinforming) 以及回文序列 (palindromic sequences)。因为 PNA 与 PNA 之间的相互作用非常强，比PNA跟DNA之间的作用强多了。
5. PNA 序列中的嘌呤含量不要太多，应低于60% ，因为嘌呤越多，溶解性越差。同时要避免 6 个嘌呤连续在一起，特别是 4 个以上的 G 连续在一起。
6. 为了提高 PNA 的溶解性，可以在序列中加入 O linker，E linker， X linker 或者 2个Lys。
PNA 设计预测：http://www.tahepna.com/tool2.asp?flag=6
