Antisense PNA（AsPNAs） 是能够与mRNA结合的寡聚核苷酸，它能够与目标基因的mRNA结合，降低mRNA的的翻译，从而使相应的蛋白表达减少或者完全没有表达。有很多用PNA作为Antisense Agents 的案例，PNA可以作为Antisense Agents 可以使很多基因突变导致的疾病得到缓解。急性肺损伤(ALI) 是一个非常复杂的疾病。用放射性物质标记的PNA-YR9，可以检测出iNOS mRNA，从而在ALI 的早期阶段就可以检测出疾病的发生。

PNA 作为Antigene Agents 能够与目标基因结合并抑制其转录。有一个研究：PNA跟NLS（细胞核定位信号肽）链接成为PNA-NLS，在被HIV长久感染的淋巴细胞和巨噬细胞中，能够非常明显地抑制HIV病毒的复制。有研究表明PNA能够缓解纤维增生性疾病（fibro-proliferative disorders）。PNA跟相应的NLS结合形成NLS，可以进入细胞核，并与目标DNA结合，抑制其转录，从而能够type I collagen 的表达量减少。

RAD51 的过量表达，会导致癌细胞对化疗的抗性增强，从而降低化疗效果。PNA-NLS 作为AgPNAs可以抑制RAD51蛋白的表达。因此PNA作为AgPNAs 是一个很有潜力的药物。